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O aumento da demanda por alimentos em muitos países evidencia a importância de estudos relacionados à produção de grãos de culturas comumente usadas na alimentação humana e animal. Avaliar a eficiência econômica de práticas agronômicas, como o uso de fungicidas, é importante para a viabilidade do cultivo de milho. O objetivo deste trabalho foi avaliar a viabilidade econômica do manejo de fungicidas na cultura do milho em ambientes subtropicais no sul do Brasil. Os experimentos a campo foram conduzidos com duas épocas de semeadura em três locais: Santa Maria, São Vicente do Sul e Frederico Westphalen, no estado do Rio Grande do Sul. O delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso com parcelas subdivididas. A parcela principal foi formada pelos dois níveis do fator fungicida (com e sem), e a subparcela pelos seis níveis do fator híbrido de milho (AG9025, AS1730, P3016, MG300, DKB230 e FEROZ). Na colheita, foram avaliadas a massa de grãos de 216 parcelas experimentais para determinar a produtividade de grãos. Para a avaliação da viabilidade econômica, foram estimados os custos de produção, considerando o custo para duas aplicações de fungicida e o valor médio de comercialização do produto nas últimas três safras (2017/2018, 2018/2019 e 2019/2020). Portanto, a avaliação da rentabilidade econômica na cultura do milho em ambientes subtropicais no sul do Brasil permitiu constatar que os híbridos mais suscetíveis em condições favoráveis ao desenvolvimento de doenças apresentam melhor custo-benefício com a aplicação de fungicidas, sendo a resistência genética uma importante ferramenta para o manejo integrado de doenças.