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Ante la persistente coincidencia en el tiempo de periodos de crecimiento economico y aceleracion del progreso tecnico, el desarrollo tecnologico y la innovacion han adquirido una importancia fundamental como objeto de estudio por parte de la ciencia economica. Dentro del ambito de la economia de la innovacion, el marco teorico de los sistemas de innovacion ofrece a las autoridades publicas una herramienta util para fomentar el desarrollo de sus respectivos paises o regiones a traves de la mejora de su desempeno en innovacion. Las estrategias de investigacion e innovacion para la especializacion inteligente (RIS3), promovidas por las instituciones europeas en el marco temporal 2014-2020, tratan de impulsar la contribucion de la politica regional de la UE a la prioridad del crecimiento inteligente establecida en la estrategia Europa 2020, a traves de la mejora del desempeno de los sistemas regionales de innovacion de la UE. La politica regional de la UE ha tenido una gran importancia historica para Andalucia, y su reforma en el periodo 2014-2020 tiene un importante impacto para la region, principalmente en terminos de reduccion de la dotacion financiera asignada y reorientacion de las inversiones. Por lo que se refiere al destino de las inversiones, en el marco temporal 2014-2020 tienen un peso muy importante las actuaciones de fomento del sistema regional de innovacion a traves de la estrategia RIS3 de Andalucia. El objetivo principal de nuestro trabajo consiste en analizar los campos de mejora del sistema andaluz de innovacion en el ambito de actuacion de la estrategia RIS3 de Andalucia, con el apoyo de los fondos de la politica regional de la UE. En este contexto, hemos pretendido reforzar el analisis DAFO contenido en la estrategia RIS3 de Andalucia, llevando a cabo un ejercicio comparativo con una amplia muestra de regiones europeas empleando la tecnica del analisis cluster, asi como desarrollando un analisis cualitativo mas detallado de la situacion de la region en relacion con una seleccion reducida de regiones. En ambos casos, hemos centrado nuestro analisis en las dimensiones estructurales consideradas determinantes para el desempeno innovador. Este ejercicio nos ha permitido enriquecer el analisis DAFO contenido en la estrategia RIS3 de Andalucia y, por ende, disenar nuevas propuestas de actuacion. ; Given the persistent coincidence in time of periods of economic growth and acceleration of technical progress, technological development and innovation have acquired great relevance as an object of study by economic science. Within the field of innovation economics, the theoretical framework of innovation systems offers public authorities a useful tool to foster the development of their respective countries or regions by improving their performance in innovation. Research and innovation strategies for smart specialization (RIS3), promoted by the EU institutions in 2014-2020 timeframe, seek to boost the contribution of EU regional policy to the priority of smart growth set out in the Europe strategy 2020, by improving the performance of regional innovation systems in the EU. EU regional policy has been of great historical importance for Andalusia, and its reform in the period 2014-2020 has a major impact on the region, mainly in terms of the reduction of the allocated financial resources and the reorientation of investments. As regards the destination of investments, in the 2014-2020 timeframe, actions to foster the regional innovation system through the Andalusian RIS3 strategy play a very important role. The main objective of our work is to analyse the fields of improvement of Andalusian innovation system within the scope of the Andalusian RIS3 strategy, with the support of EU regional policy funds. In this context, we intend to reinforce the SWOT analysis included in the RIS3 strategy of Andalusia, carrying out a comparative exercise with a large sample of European regions using the cluster analysis technique, as well as developing a more detailed qualitative analysis of the situation of the region in relation to a selection of regions. In both cases, we have focused our analysis on the structural dimensions considered determinant for the innovative performance. This exercise has allowed us to enrich the SWOT analysis included in the RIS3 strategy of Andalusia and, therefore, to design new proposals for action.